Hồ sơ gồm có:
1. Đơn đề nghị cấp giấy chứng nhận (theo mẫu);
2. Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh (sao y công chứng);
3. Bản thuyết minh về điều kiện cơ sở vật chất đủ điều kiện vệ sinh an toàn thực phẩm (bản vẽ sơ đồ mặt bằng sản xuất kinh doanh; mô tả quy trình chế biến thực phẩm);
4. Bản cam kết đảm bảo vệ sinh an toàn thực phẩm đối với nguyên liệu thực phẩm và sản phẩm do đơn vị sản xuất kinh doanh;
5. Chứng nhận sức khoẻ của người trực tiếp sản xuất kinh doanh do cơ sở y tế có thẩm quyền cấp;
6. Chứng nhận hoàn thành khoá tập huấn về vệ sinh an toàn thực phẩm cho người trực tiếp sản xuất kinh doanh thực phẩm.
Qui trình thẩm định và cấp GCN như sau:
- Sở Y tế TP tiếp nhận hồ sơ, cấp GCN cho các cơ sở được TP và trung ương cấp GCN đăng ký kinh doanh; các nhà hàng, bếp ăn tập thể có qui mô từ 200 người ăn trở lên; các dịch vụ ăn uống từ các khu công nghiệp, siêu thị, chợ, bệnh viện; các khu du lịch do TP quản lý, các khách sạn một sao trở lên và trong các trường học từ THPT trở lên.
- UBND quận, huyện tiếp nhận hồ sơ, cấp GCN cho các cơ sở do quận, huyện cấp GCN đăng ký kinh doanh; các cửa hàng ăn, các căngtin, nhà hàng ăn uống, bếp ăn tập thể, khách sạn không thuộc diện TP cấp GCN; trường THCS trở xuống; các khu du lịch, chợ và bệnh viện do quận, huyện quản lý.
- Các cơ sở không thuộc diện phải đăng ký kinh doanh như các hộ gia đình, cá nhân sản xuất thực phẩm bao gói đơn giản, kinh doanh hàng tươi sống không bao gói; các quán ăn, quầy bán thực phẩm chế biến sẵn để ăn ngay trong ngày và các chợ, khu du lịch do phường xã quản lý; các trường tiểu học, mầm non không thuộc diện quản lý của cấp trên, có vị trí kinh doanh cố định theo qui định mới cũng phải có GCN đủ điều kiện VSATTP. Đối tượng này do UBND phường, xã tiếp nhận hồ sơ, cấp GCN.
- Các hộ buôn bán rong không thuộc đối tượng phải đăng ký cấp giấy chứng nhận theo qui định này.